Saturday, August 24, 2013

eQTL: expression Quantitative Trait Locus

ESCs, iPSCs, MSCsに関して、ゲノムSNPとexpression pattern (Agilent platform)を比べることができる。

eQTLとはexpression Quantitative Trait Locusの略のことで遺伝子発現に影響を及ぼすとされるゲノム上の位置(または領域)...

例えば、Collagenase I の転写調節領域のSNPと発現(10倍以上違わないとダメ)。発現の違いは100倍ぐらいあるとさらにいいね。

結構、大事なのはCYP遺伝子群のSNPなのだろうが、既にかなりな情報が得られていると予想される。こんど、専門家に聞いてみよう。




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